Alors que le Sommet des Chefs d’Etat et de Gouvernement est l’organe d’orientation de la COMIFAC, le Conseil des Ministres quant à lui est l’organe de décision, de coordination et de contrôle de la mise en œuvre des politiques en matière de gestion durable des écosystèmes forestiers d’Afrique Centrale au sein de la COMIFAC.

Le Conseil des Ministres est composé des Ministres en charge des Forêts et/ou de l’Environnement de chaque État membre de la COMIFAC. D'après l'article 10 du Traité constitutif, le Conseil des Ministres est chargé de :

• veiller à l’exécution des orientations prises par le Sommet des Chefs d’Etat et de Gouvernement;

• proposer le lieu, la date ainsi que l’ordre du jour du Sommet des Chefs d’Etat et de Gouvernement;

• nommer et révoquer les membres du Secrétariat Exécutif;

• orienter et évaluer l’action du Secrétariat Exécutif;

• examiner et adopter le budget du Secrétariat Exécutif;

• approuver et faire auditer les comptes;

• approuver la rémunération des différentes catégories de personnel;

• exercer conjointement avec le Secrétariat Exécutif, le pouvoir disciplinaire.

Le Conseil des Ministres se tient en session ordinaire tous les deux ans. Des sessions extraordinaires peuvent également convoquées par le Président en exercice de la COMIFAC. Depuis 2000, date de création de la COMIFAC, Le Conseil des ministres s’est réuni au cours des sessions qui ont été sont sanctionnés par des Communiqués finaux.

Les Sessions des Conseils des Ministres suivantes ont été tenues (télécharger les communiqués finaux):

• Neuvième session ordinaire du Conseil des Ministres de la Commission des Forêts d’Afrique Centrale (COMIFAC) tenue le 29 novembre 2016 à Kigali en République du Rwanda
• Session extraordinaire du Conseil des Ministres en charge de l’Environnement et des Forêts des pays membres de la COMIFAC tenue le 12 mai 2016 à Kinshasa en République Démocratique du Congo
• Huitième session ordinaire du Conseil des Ministres de la Commission des Forêts d’Afrique Centrale (COMIFAC) tenue le 16 janvier 2015 à Bujumbura en République du Burundi
• Session extraordinaire du Conseil des Ministres en charge de l’Environnement et des Forêts des pays membres de la COMIFAC tenue le 18 juillet 2014 à Brazzaville (République du Congo)
• Session extraordinaire du Conseil des Ministres en charge de l’Environnement et des Forêts des pays membres de la COMIFAC tenue le 08 novembre 2013 à N’djamena (République du Tchad)
• Septième session ordinaire du Conseil des Ministres de la Commission des Forêts d’Afrique Centrale (COMIFAC) tenue le 21 novembre 2012 à N’djamena en République du Tchad
• Session extraordinaire des Ministres en charge de l’Environnement et des Forêts des pays membres de la COMIFAC tenue le 06 juin 2012 à N’djamena (République du Tchad)
• Session extraordinaire des Ministres en charge de l’Environnement et des Forêts des pays membres de la COMIFAC tenue le 18 mai 2011 à Kinshasa (République Démocratique du Congo);
• Sixième session ordinaire du Conseil des Ministres tenue les 10 et 11 novembre 2010 à Kinshasa en République Démocratique du Congo

• Réunion Ministérielle Post Copenhague tenue le 21 avril 2010 à Brazzaville au Congo

• Conférence extraordinaire des Ministres CEEAC-COMIFAC tenue du 14 au 15 septembre 2009 à Kinshasa en République Démocratique du Congo

• Conseil Extraordinaire des Ministres tenu les 26 et 27 octobre 2008 à Brazzaville au Congo

• Cinquième Session ordinaire du Conseil des Ministres tenue du 09 au 11 septembre 2008 à Bangui en République Centrafricaine

• Conseil extraordinaire des Ministres tenu le 29 novembre 2006 à Mongomo en Guinée Équatoriale

• Quatrième Session ordinaire du Conseil des Ministres tenue le 21 septembre 2006 à Malabo en Guinée Équatoriale

• Deuxième Conférence Extraordinaire des Ministres tenue le 30 septembre 2004 à Libreville au Gabon

• Troisième Conférence ordinaire des Ministres tenue du 20 au 22 juillet 2004 à Libreville au Gabon

• Session extraordinaire de la Conférence des Ministres tenue du 26 au 29 mai 2004 à Yaoundé au Cameroun

• Deuxième conférence des ministres tenue du 27 au 28 juin 2002 à Yaoundé au Cameroun

• Première Session de la Conférence des Ministres tenue les 06 et 07 décembre 2000 à Yaoundé au Cameroun.